大雨過後，作物易發生的病害包括疫病菌引起的木瓜果疫病、柑桔類果實褐腐病、蔬果類疫病，這類病害農民俗稱「滾水病」、「水菇病」或「水傷」，係由疫病菌藉由雨水飛濺傳播感染，大風大雨易造成果實傷口，加上雨天環境中濕度高，利於病原菌侵染及繁殖而造成果實腐爛；其它藉雨水傳播的真菌感染可造成炭疽病、蒂腐病、果腐病等。

        另外細菌性病害更是容易藉由雨水散播，例如蔬果類的細菌性斑點病、軟腐病、果斑病、果樹上的細菌性潰瘍病、斑點病、水稻上的白葉枯病等，均可藉由雨水而快速蔓延，為避免近日的大雨引發這些病害的發生，田間宜加強排水，降低濕度，雨後出現的落果、罹病的植物組織等，應儘速清除以降低病原菌密度，再配合施藥防治，才能有效控制病害之蔓延。