農委會強調自由經濟示範區（簡稱示範區）開放管制原料進口會嚴格控管，其產品並以外銷為主；國產花生做為製造花生醬原料之比例僅約 1.76% ，並非六分之一；市售花生醬約 29% 為國產，並非學者所稱 80% ；示範區農業加值亦未減免營利事業所得稅。示範區農業加值不但不會影響國內農業，反有機會拓展外銷，並帶來投資與就業機會。

　示範區農業加值事業需依特別條例 ( 草案 ) 之規定進行審查，包括產品需以外銷為主、可內銷產品其國內原料採購數量需大於內銷產品數量，以及使用管制性原料需經審查等，不是任意開放。
　　示範區輸入之原料做成外銷產品才可免關稅；區內產品若可內銷者，則仍須課徵關稅、貨物稅及營業稅；農業加值亦未減免營利事業所得稅。示範區係提供境內關外的便捷經營環境及單一窗口行政服務，而非稅負減免，不會造成區內外不公平競爭，亦不會影響國內市場。
以花生與花生醬為例，花生醬原即為可進口的產品，若進口原料花生至示範區加工成花生醬，欲銷到國內，仍須課以花生醬關稅 25% 始得輸入，與直接由國外輸入完全相同。若在示範區設廠製造，可帶來投資與就業，但若在國外生產，這些都沒了。

　農委會指出國產落花生 101 年種植面積約 19,430 公頃，產量約 56,844 公噸，主要供整顆使用高價市場所需，包括帶殼烹煮、脫仁培炒、花生仁罐頭加工等；國內生產花生醬之廠商家數少，目前國內消費之花生醬多由國外直接進口，據中華民國落花生產業協會估計，用於生產花生醬的國產原料花生約 1,000 公噸，占國產花生產量 1.76% ，而非學者所稱六分之一。
我國加入 WTO （ 91 年）後，花生醬關稅為 25% ，且開放自中國大陸進口。 101 年花生醬進口量為 2,813 公噸（主要進口來源為中國大陸 1,336 公噸，占 47% ），出口為 12 公噸。依前述國產花生原料約製成 1,166 公噸花生醬，換算國人消費花生醬共計約 3,967 公噸，其中國產占 29% ，而非學者所稱 80% 。

　另「只要產品在自經區進行 35% 的加工，就能掛上 Made in Taiwan 」之說法，亦有所誤導。臺灣原產地證明 ( 一般稱 MIT) 之規定、核發及查核等控管機制，依經濟部法規已行之多年，其中對於加工 ( 值 ) 後產品附加價值達一定比率以上 ( 例如國內現行規定為加值 35% 以上 ) ，得認定製造地為原產地一節，為國際間所遵循之慣例，示範區並未放寬。推動示範區，仍秉持行之多年的原產地證明一貫原則辦理，自然不會影響 MIT 品質形象。另外，進駐示範區業者主要看重我國在食品領域之安全與衛生形象，業者為維護其品牌形象及商譽，定會重視其產品之安全，政府亦會輔導及鼓勵業者依市場需求進行標示。

　　示範區農業加值政策既然是一個可以嘗試、也必須嘗試的方法，農委會期待能透過與媒體的互動、與國會及民眾的充分溝通，爭取支持。在推動過程中也會仔細評估，謹慎調整相關作法，並在未來的雙邊或多邊談判中，持續為農業爭取最有利的條件。一方面爭取調適期間，一方面也逐步帶領農業升級轉型，讓農業成為具國際競爭力之產業。